水谷豊主演の大ヒット刑事ドラマの劇場版第２弾。
警察組織内部に渦巻く恐るべき陰謀に立ち向かう特命係の右京、尊の活躍を骨太のストーリー展開で描き出す。
及川光博、岸部一徳らのレギュラー陣に加え、小西真奈美、小澤征悦、宇津井健、國村隼ら豪華ゲスト陣も多数出演。監督は前作に引き続いてのメガフォンとなる和泉聖治。

　警察組織の要所である警視庁本部内で、警視総監以下、幹部12名を人質に取った前代未聞の籠城事件が発生する。
犯人からの要求のないまま時間ばかりが過ぎ、捜査本部が対応に苦慮する中、杉下右京と神戸尊は犯人が元警視庁刑事の八重樫であることを突き止める。
しかし、右京の意見が聞き入れられることなく、事件は機動隊と特殊捜査班の強行突入による犯人の射殺と人質全員の解放によって幕を閉じる。ところが八重樫の動機は結局不明のまま、人質となった幹部たちも一様に曖昧な証言に終始する。
一連の事態に疑問を抱いた右京と尊は、真相を探るべく独自の調査を開始するが…。