FBIボストン支局の捜査官オリビアは、「フリンジ・チーム」と呼ばれる部署で、各地で頻発する不可解な事件の捜査を担当している。
ビショップ博士らの協力により、「パターン」と呼ばれる現象がそれらを引き起こしていることが判明し、チームはその究明のためパラレルワールドにまで足を踏み入れることに。
世界の危機を救うため別の世界へと旅立ったものの、オリビアは逆にそこに一人取り残されてしまう。